Отдел осуществляет координацию деятельности структурных подразделений больницы по организации диагностических, профилактических и противоэпидемических мероприятий, направленных на выявление, локализацию и ликвидацию эпидемических очагов, работу по предупреждению распространения в медицинской организации возбудителей инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи,  а также других инфекционных (паразитарных) заболеваний.