Организационно-методический отдел функционирует для координации деятельности медицинских организаций государственной системы здравоохранения Республики Дагестан, обслуживающих взрослое и детское население (инфекционных стационаров, инфекционных отделений (корпусов многопрофильных стационаров, специализированных центров, кабинетов (отделений) инфекционных заболеваний).

ОМО является методическим центром, участвующим в разработке организационных, методических, правовых и иных аспектов деятельности медицинских организаций, направленных на совершенствование лечебно-диагностического процесса при инфекционных болезнях, а также контроля за их качеством.

Оказание организационно-методической и консультативной помощи руководству, администрации и сотрудникам медицинских организаций государственной системы здравоохранения Республики Дагестан по инфекционным болезням с целью повышения качества и эффективности медицинского обслуживания, совершенствования знаний и квалификации медицинского персонала. Участие в работе комиссий и групп, создаваемых для комплексных проверок деятельности медицинских организаций.

Участие в организации обучения медицинских работников медицинских организаций государственной системы здравоохранения Республики Дагестан по инфекционным болезням.

Участие в разработке методических пособий, рекомендаций и указаний по улучшению организации деятельности медицинских организаций по разделу инфекционные болезни.

Участие в плановых и внеплановых проверках деятельности медицинских организаций по своему разделу.